V novém příběhu bude Naruto čelit různým výzvám, aby ochránil Hidden Leaf vesnici a vesničany před ďábelskou silou, která se snaží ji ovládnout. Starověká organizace, o které se myslelo, že už je rozpuštěna, stále existuje a hledá prstence ke vzkříšení mechanického teroru. Nyní je na Narutovi a všech z Hidden Leaf Genin, aby spojili síly s těmi s Hidden Sand vesnice a zastavili tuto hrozbu.