Příběh hry Valkyria Revolution se odehrává po proběhlé revoluci, kdy se musí elitní jednotka vojáků Jutlandu Vanargand postavit a porazit říši Ruzi a hlavně zastavit Valkyrie, které na bojišti rozsévají mezi řadovými vojáky smrt. Tato anti-Valkyrií četa je naštěstí vybavena účinnými zbraněmi, používajícími manu a také dokáže v boji proti této děsivé hrozbě používat kouzla, fungující díky krystalům ragnite.
Jednotka se skládá z vojáků, kteří jsou vůči ragnite velmi odolní a dokonce se k nim přidá i jutská princezna Ophelia. Princezna cítí za svou zemi odpovědnost a tak odpoví na volání do zbraně a pokusí se svým dílem přispět k osvobození těch, kteří trpí pod tyranií Ruzi. Bohužel velící důstojník Vanargandu Amleth Gronkjar, patrně skrývá před ostatními strašlivé tajemství. Nikdo tak vlastně neví, jestli je to přítel nebo nepřítel země, kterou přísahal chránit.
Valkyria Revolution tak není pouze další epizodou legendární série Valkyria, ale úplně nová hra s novými postavami, novým světem a také novými herními mechanismy. Původní statické tahové bojiště se změnilo a je teď zaměřené více na konkrétní akce, kde můžete na blízko vytvářet devastující komba, smrtící útoky na dálku nebo se strategicky přesouvat a měnit tak průběh bitvy ve svůj prospěch.